Jag skulle vilja veta vad verifierar folk när de utformar / använder spike-in-kontroller, som ska användas i sekvenseringsexperiment (främst Illumina). Hittills har jag kommit med den här listan:
- Anpassar den bara till ett visst genom-syntetisk referens?
- Innehåller den G-fyrdubblaxar? T.ex. QGRS Mapper
- Innehåller det kända Illumina-felmotiv? (Har det någon betydelse längre för de senaste plattformarna / kemierna?) Se den här artikeln
- Innehåller det andra motiv som är kända för att vara polymerashämmare? Ref
Något annat?