Hur kan jag färglägga rutor i Gviz AnnotationTrack i R?

Chris_Rands

2017-11-15 15:43:17 UTC

view on stackexchange narkive permalink

Jag lär mig Gviz-bioledarpaketet, jag genererar en plot enligt följande:

  bibliotek (Gviz) spår <- AnnotationTrack (start = c (1,5,7), slut = c (2,6,10), strand = c ('*', '*', '*'), stapling = "tät", showFeatureId = SANT, id = c ('röd', 'blå', ' red ')) pdf (file = paste ("test", "pdf", sep = ".")) plotTracks (track) dev.off ()

test. pdf ser ut så här:

Men vad jag vill är att rutorna ska färgas snarare än märkta med färgordet, hur man gör ?

Observera att mitt riktiga exempel är mycket mer komplicerat än detta.

spår <- AnnotationTrack (start = c (1,5 , 7), slut = c (2,6,10), sträng = c ('*', '*', '*'), stapling = "tät", showFeatureId = SANT, id = c ('röd', 'blå', 'röd'), fyll = c ('röd', 'blå', 'röd'))